Le capitaine DeSalle et l’Enterprise NCC-1701-E ont reçu l’ordre d’enquêter sur la disparition de deux vaisseaux dans la forêt tropicale de Sipar sur Tixalia 4. Sipar est et a toujours été un lieu important de la culture religieuse de Tixalia et tous les temples de la forêt sont des monuments protégés. Surtout la Forteresse Monument de Telaar, un des bâtiments les plus sacrés de ce système solaire. Les Tixaliens, membres de la Fédération, ont autorisé le plus haut gradé du vaisseau à pénétrer seul dans la forêt sacrée. Il s’agit donc du capitaine, bien sûr, téléporté en tenue de cérémonie, malgré les protestations de son premier officier, le commandant Ciprach.
DeSalle trouve l’origine des tirs qui ont détruit les deux vaisseaux... après des millénaires la Forteresse Monument de Telaar, paisible lieu de culte religieux, se réveille et ses mécanismes de défenses les plus mortels mettent en péril le capitaine et son vaisseau en orbite. DeSalle, pendant que son navire se rapproche de la destruction, est prisonnier d’un effroyable dilemme. Le Monument est sacré et, d’une autre façon, la vie de son équipage aussi...
Le film est tiré de l’univers créé par Gene Roddenberry. Bien qu’il se situe sur l’Enterprise NCC-1701-E, avec l’équipage qui a succédé à celui du valeureux capitaine Picard (Star Trek The Next Generation), il glorifie l’esprit qui a fait la grandeur de la Série Originale, un mélange de candeur des sixties et d’optimisme issu de la présidence de John Kennedy.
La musique du film rend hommage au génie de Jerry Goldsmith, qui sut s’illustrer dans tous les genres avec le même éclat et qui marqua tant la saga de Gene Roddenberry.
Star Trek Monument est respectueusement dédié à la mémoire de ces deux génies qui l’ont inspiré.